Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hif3aQ0VBL6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hif3aQ0VBL6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms