Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Vps8Q0P5W1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vps8Q0P5W1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Vps8Q0P5W1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms