Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssrp1Q08943 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms