Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tff1Q08423 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff1Q08423 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms