Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cnn1Q08091 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cnn1Q08091 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn1Q08091 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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