Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Pou6f1Q07916 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou6f1Q07916 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms