Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NrepQ07475 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms