Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdf3Q07104 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdf3Q07104 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms