Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrx2Q06348 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms