Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox13Q04891 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms