Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcr5Q04683 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcr5Q04683 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms