Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scg2Q03517 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scg2Q03517 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms