Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkczQ02956 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkczQ02956 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkczQ02956 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkczQ02956 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkczQ02956 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkczQ02956 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkczQ02956 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrkczQ02956 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkczQ02956 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkczQ02956 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms