Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Col6a2Q02788 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col6a2Q02788 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col6a2Q02788 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms