Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GscQ02591 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GscQ02591 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GscQ02591 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GscQ02591 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GscQ02591 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GscQ02591 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GscQ02591 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GscQ02591 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GscQ02591 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GscQ02591 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GscQ02591 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GscQ02591 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GscQ02591 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GscQ02591 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms