Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnnb1Q02248 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnnb1Q02248 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms