Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snai1Q02085 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snai1Q02085 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms