Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cacna1cQ01815 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cacna1cQ01815 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms