Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pde1bQ01065 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms