Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csf2raQ00941 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf2raQ00941 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms