Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp1Q00915 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms