Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col8a1Q00780 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col8a1Q00780 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms