Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms