Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VldlrP98156 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms