Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scn1bP97952 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms