Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra1P97785 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms