Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cited1P97769 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cited1P97769 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cited1P97769 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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