Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp1P97350 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms