Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx1P83917 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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