Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NyxP83503 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NyxP83503 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NyxP83503 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NyxP83503 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NyxP83503 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NyxP83503 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NyxP83503 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NyxP83503 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NyxP83503 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NyxP83503 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NyxP83503 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NyxP83503 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NyxP83503 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NyxP83503 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NyxP83503 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NyxP83503 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NyxP83503 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NyxP83503 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NyxP83503 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NyxP83503 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NyxP83503 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NyxP83503 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NyxP83503 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NyxP83503 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NyxP83503 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NyxP83503 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NyxP83503 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NyxP83503 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NyxP83503 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NyxP83503 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NyxP83503 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NyxP83503 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NyxP83503 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NyxP83503 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NyxP83503 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NyxP83503 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NyxP83503 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NyxP83503 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NyxP83503 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NyxP83503 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NyxP83503 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NyxP83503 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NyxP83503 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NyxP83503 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NyxP83503 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NyxP83503 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NyxP83503 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NyxP83503 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NyxP83503 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NyxP83503 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NyxP83503 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NyxP83503 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NyxP83503 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NyxP83503 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NyxP83503 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NyxP83503 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NyxP83503 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NyxP83503 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NyxP83503 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NyxP83503 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NyxP83503 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NyxP83503 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NyxP83503 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NyxP83503 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NyxP83503 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NyxP83503 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NyxP83503 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NyxP83503 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NyxP83503 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NyxP83503 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NyxP83503 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NyxP83503 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NyxP83503 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NyxP83503 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms