Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx1P82976 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbx1P82976 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms