Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx3P81067 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irx3P81067 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx3P81067 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms