Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufd1P70362 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufd1P70362 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms