Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SbdsP70122 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbdsP70122 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SbdsP70122 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SbdsP70122 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms