Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms