Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vamp2P63044 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vamp2P63044 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms