Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rps28P62858 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rps28P62858 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rps28P62858 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rps28P62858 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rps28P62858 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps28P62858 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms