Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhobP62746 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhobP62746 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhobP62746 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhobP62746 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhobP62746 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhobP62746 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhobP62746 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhobP62746 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhobP62746 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhobP62746 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhobP62746 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhobP62746 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhobP62746 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RhobP62746 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhobP62746 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhobP62746 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhobP62746 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhobP62746 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhobP62746 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhobP62746 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms