Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f4P62515 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou3f4P62515 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms