Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufm1P61961 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufm1P61961 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms