Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme3P61290 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme3P61290 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme3P61290 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms