Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2kP61087 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2kP61087 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms