Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5bP61021 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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