Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcif1P59114 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms