Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp3P59055 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp3P59055 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp3P59055 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp3P59055 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp3P59055 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp3P59055 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp3P59055 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Csrnp3P59055 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Csrnp3P59055 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Csrnp3P59055 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Csrnp3P59055 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms