Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm2P58774 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms