Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp25P57080 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp25P57080 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp25P57080 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp25P57080 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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