Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aqp4P55088 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aqp4P55088 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aqp4P55088 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aqp4P55088 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aqp4P55088 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Aqp4P55088 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aqp4P55088 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aqp4P55088 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Aqp4P55088 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aqp4P55088 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aqp4P55088 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms