Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Map3k1P53349 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Map3k1P53349 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms