Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XpcP51612 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XpcP51612 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XpcP51612 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XpcP51612 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XpcP51612 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XpcP51612 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XpcP51612 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XpcP51612 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XpcP51612 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XpcP51612 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XpcP51612 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XpcP51612 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XpcP51612 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XpcP51612 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XpcP51612 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XpcP51612 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
XpcP51612 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XpcP51612 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
XpcP51612 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XpcP51612 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XpcP51612 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
XpcP51612 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XpcP51612 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpcP51612 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpcP51612 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpcP51612 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpcP51612 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpcP51612 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XpcP51612 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpcP51612 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpcP51612 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpcP51612 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpcP51612 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XpcP51612 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XpcP51612 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XpcP51612 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XpcP51612 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XpcP51612 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XpcP51612 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XpcP51612 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XpcP51612 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XpcP51612 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XpcP51612 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XpcP51612 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XpcP51612 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XpcP51612 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpcP51612 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XpcP51612 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XpcP51612 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XpcP51612 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XpcP51612 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XpcP51612 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XpcP51612 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XpcP51612 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XpcP51612 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XpcP51612 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XpcP51612 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XpcP51612 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XpcP51612 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XpcP51612 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XpcP51612 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XpcP51612 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XpcP51612 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XpcP51612 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XpcP51612 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XpcP51612 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XpcP51612 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XpcP51612 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XpcP51612 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XpcP51612 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XpcP51612 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XpcP51612 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XpcP51612 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms