Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms